Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dll3O88516 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dll3O88516 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms