Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms