Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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