Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grpel2O88396 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms