Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vti1bO88384 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vti1bO88384 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms