Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srpk1O70551 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms