Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtssO70370 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtssO70370 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtssO70370 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms