Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms