Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RngttO55236 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RngttO55236 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RngttO55236 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RngttO55236 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RngttO55236 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RngttO55236 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms