Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Supt5hO55201 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms