Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cbx4O55187 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms