Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp2a2O55143 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms