Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copb2O55029 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms