Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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