Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms