Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6bO54951 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms