Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f6O54917 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms