Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb3O54890 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb3O54890 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms