Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms