Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp10aO54827 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp10aO54827 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms