Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limk2O54785 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limk2O54785 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms