Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elovl3O35949 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms