Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CaluO35887 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CaluO35887 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CaluO35887 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CaluO35887 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CaluO35887 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CaluO35887 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CaluO35887 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms