Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tnfrsf18O35714 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tnfrsf18O35714 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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