Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn1mwO35599 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn1mwO35599 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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