Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk3O35492 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms