Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema6aO35464 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms