Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TnxbO35452 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms