Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-ObO35424 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-ObO35424 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms