Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pld3O35405 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pld3O35405 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pld3O35405 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pld3O35405 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms