Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc1O35379 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc1O35379 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc1O35379 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms