Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmd4O35226 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmd4O35226 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms