Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad6O35182 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms