Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pitx3O35160 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms