Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr1aO35134 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr1aO35134 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms