Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarb2O35114 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarb2O35114 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms