Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HgdO09173 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HgdO09173 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HgdO09173 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HgdO09173 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms