Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epha8O09127 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epha8O09127 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms