Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurod4O09105 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurod4O09105 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms