Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms