Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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