Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8888J3QPX5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms