Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccer2J3QPU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms