Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2035J3QP87 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm2035J3QP87 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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