Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim18J3QNP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim18J3QNP2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim18J3QNP2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim18J3QNP2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim18J3QNP2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim18J3QNP2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim18J3QNP2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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