Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21976J3QNN2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Gm21976J3QNN2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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