Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21972J3QN38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21972J3QN38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms