Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20918J3QN17 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20918J3QN17 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20918J3QN17 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20918J3QN17 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20918J3QN17 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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