Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm16434J3QN10 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm16434J3QN10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.3 ms