Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms